Histoire : Taiki Kudo est un garçon en classe de cinquième qui aide ceux qui en ont besoin. Un jour, quand les réseaux digitaux se sont mis à dérailler, il a entendu la voix d'un Digimon nommé Shoutmon murmurant qu'il allait bientôt mourir. Cherchant à l'aider, Taiki obtient un digivice connu sous le nom d' Xros Loader' et lui, ainsi que ses amis Akari Hinomoto et Zenjirou Tsurugi, sont transférés dans le digimonde où ils rencontrent les alliés de Shoutmon: Ballistamon, Starmon et les Pickmons. En utilisant les pouvoirs de son digivice, Taiki peut aider ces Digimon à se digivolver et fusionner à volonté. Taiki et ses amis sont actuellement les seuls opposant de l'Empire Bagura.