Histoire : Nous sommes en l'an 2010, le Japon a été envahi par l'empire de Britannia (à la base les Occidentaux, qui ont envahi le globe, Britannia venant de "Britain" : la Grande-Bretagne).
Le Japon n'est plus qu'une contrée de l'empire appelée "Zone 11" (Area 11), conquise de force par de nouvelles unités : les "Nightmares Frame".
Les "Elevens" (anciens habitants du japon) n'ont plus aucun droit et plus aucune liberté.
Cependant, malgré le régime de terreur que l'empire a instauré depuis 7 ans d'occupation, certains "Elevens" se révoltent et s'organisent en une résistance...
Lelouch, jeune lycéen doté d'un sens de la réflexion très poussé, obtient le pouvoir du Geass par CC, voulant probablement causer une révolution au sein de l'Empire Britannique et prendre le pouvoir de cette résistance ??