Histoire : Pendant l'ère Edo, deux grands clans de ninjas se vouent une rivalité et une haine sans merci. L'ancêtre de Hattori Hanzo (maître des Ninjas), a depuis 400 ans fait signé un pacte de non-agression aux deux clans de ninjas légendaires : les Kôga et les Iga.
Cependant, le Shôgun Tokugawa Ieyasu veut choisir un héritier pour lui succéder.
Après avoir consulté le prêtre Nakôbô Tenkaï, il décide alors d'annuler le pacte de non-agression et demande aux familles Kôga et Iga de choisir dix maîtres Ninjas qui devront s'entretuer. Les deux familles représentent alors l'un des deux successeurs au rang de Shogun : les fils Tokugawa. Le dernier survivant donnera alors le pouvoir à l'héritier qu'il représente. Le vainqueur apportera alors mille ans de prospérité à sa famille.
L'histoire serait ma foi fort simple si cela s'arrêtait ainsi. Cependant, les jeunes héritiers de chaque famille : Gennosuke Kôga et Oboro d'Iga s'aiment profondément et étaient normalement sur le point de se marier...